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基因合成白皮書—商業(yè)化基因合成的發(fā)展歷程、趨勢和人工智能創(chuàng)新

發(fā)布時間:2025-03-25

一、商業(yè)化基因合成的興起

隨著生命科學研究的不斷深入以及生物技術應用的日益廣泛,對基因合成的需求逐漸從科研領域拓展到更廣闊的商業(yè)應用。早期,基因合成主要服務于基礎科研,用于驗證理論假設、構建基因模型等。但隨著制藥、農(nóng)業(yè)、工業(yè)生物技術等行業(yè)的快速發(fā)展,對特定基因序列的定制需求呈爆發(fā)式增長。這種需求的變化不僅體現(xiàn)在數(shù)量上,更體現(xiàn)在對合成速度、準確性成本等多方面的更高要求。


在制藥領域,為了開發(fā)新型藥物,需要快速合成大量不同的基因序列用于藥物靶點篩選和藥物研發(fā);在農(nóng)業(yè)方面,培育具有優(yōu)良性狀的轉基因作物也依賴于高效的基因合成技術。合成生物學領域,低成本基因合成能夠顯著加速科研創(chuàng)新、降低生物技術開發(fā)成本,并推動食品、醫(yī)美、能源、化工領域的產(chǎn)品應用開發(fā)及商業(yè)化落地。這種不斷增長和變化的需求,促使商業(yè)化基因合成行業(yè)迅速崛起,也為后續(xù)一系列創(chuàng)新型公司的發(fā)展提供廣闊的市場空間。


二、商業(yè)化基因合成的規(guī)范

? 早期商業(yè)化基因合成技術

早期的基因合成主要基于PCR的逐步拼接法,通過化學方法合成一系列短的寡核苷酸片段,并利用酶學反應將這些寡核苷酸片段按照正確的順序拼接起來,逐步構建出完整的基因序列。


Step-by-step Assembly of PCR

分步組裝PCR


? 優(yōu)缺點

優(yōu)點:技術準確性高,能夠精確合成特定序列的基因,且技術流程成熟,合成成功率有保障。 

缺點:合成效率低,操作復雜耗時,成本較高,限制了大規(guī)模應用。


? 代表公司:Gene Art

Gene Art作為商業(yè)化基因合成的先驅,通過建立標準化的操作流程和質量控制體系,率先將基因合成服務規(guī)范化、商業(yè)化,成為連接科研需求與專業(yè)基因合成服務的重要橋梁。其開發(fā)的標準流程和質量控制體系成為行業(yè)內的參考標準,它成功的運營模式也為后來者提供借鑒,促使更多公司進入基因合成市場,推動整個行業(yè)的蓬勃發(fā)展。


三、市場需求驅動下的高通量基因合成

? 市場需求

2025年,全球基因合成市場規(guī)模預計為28億美元,預計2032年將達到83億美元(復合年增長率17.7%)。隨著生命科學研究邁入組學時代以及生物技術產(chǎn)業(yè)的規(guī)?;l(fā)展,市場對基因合成的通量提出更高的要求。傳統(tǒng)的基因合成技術無法滿足同時合成大量不同基因的需求,例如在藥物篩選中,需要同時測試成千上萬種不同的基因變體對藥物的反應;在合成生物學領域,構建復雜的生物系統(tǒng)也需要大量不同功能的基因。在這種市場需求的驅動下,高通量基因合成技術應運而生。


來源: Market.US, "Gene Synthesis Market," 2023


? 高通量基因合成技術

高通量基因合成(High-throughput Gene Synthesis, HTGS)是一種能夠同時、大規(guī)模合成大量不同基因序列的技術。相較于傳統(tǒng)的基因合成方法(固相合成),高通量基因合成技術基于芯片技術,采用自動化、高效并行的方式,在短時間內合成上千甚至上萬條基因序列,為大規(guī)模基因工程研究提供強大支持。


Chip-based High-throughput Synthesis

基于芯片的高通量合成


? 優(yōu)缺點

優(yōu)點:合成通量高、成本低、靈活性高。 

缺點:復雜序列的合成準確性有待提升。 


? 代表公司:Twist Bioscience

Twist Bioscience專注于高通量基因合成解決方案。它打破傳統(tǒng)基因合成的通量限制,推動基因合成服務向高通量、低成本方向發(fā)展,加速相關領域的創(chuàng)新步伐,也為行業(yè)帶來新的商業(yè)模式和發(fā)展機遇。


四、AI賦能基因合成

? 現(xiàn)有技術的局限與行業(yè)難點

盡管高通量基因合成技術在通量和成本上取得顯著的突破,但市場多樣化需求仍對其提出了更高的挑戰(zhàn)。

√ 超長基因序列合成效率受限; 

 復雜序列(如高GC區(qū)域、重復序列)錯誤率高;  

 在基因設計階段,難以精準優(yōu)化功能需求。 


? AI賦能基因合成技術

通過人工智能算法,對基因序列進行深度分析和優(yōu)化,從而顯著提高合成效率和準確性。AI技術不僅能夠預測和解決復雜序列中的潛在問題,還能在設計階段提供精準的基因序列優(yōu)化方案,確保合成的基因序列完全符合功能需求,適用于從基礎研究到工業(yè)應用的多樣化需求,包括基因構建、基因編輯、高通量文庫構建等。


? 優(yōu)缺點

優(yōu)點:智能化設計,提升復雜序列合成成功率。 

缺點:AI技術仍處于發(fā)展階段,算法需持續(xù)優(yōu)化。


? 代表公司:Synbio Technologies

泓迅生物致力于成為合成生物學賦能技術領導者,作為首家將AI技術引入基因合成領域的公司,旨在通過AI賦能基因合成,解決高難度、復雜基因序列合成難題,為客戶提供智能化、精準化的基因合成解決方案。


自主研發(fā)生物智能分析工具:

 Complex Index(CI):解決高難度序列(重復序列、發(fā)卡結構、高GC)合成。

 NG Codon:密碼子優(yōu)化設計,提高蛋白表達效率。

 AI-TAT:精準預測生產(chǎn)周期,便于客戶合理安排后續(xù)實驗。



? 行業(yè)貢獻

泓迅生物將AI技術引入基因合成,為行業(yè)帶來全新的思路和解決方案。它推動基因合成技術從傳統(tǒng)的經(jīng)驗驅動向數(shù)據(jù)驅動、智能驅動的方向轉變,為解決難度基因合成提供新的途徑,也為整個行業(yè)的技術升級和創(chuàng)新發(fā)展注入新的活力。

 

五、未來展望:商業(yè)化基因合成的機遇與挑戰(zhàn)

隨著商業(yè)化基因合成的不斷發(fā)展,未來基因合成行業(yè)有望迎來新的變革—生物體合成(In VivoSynthesis)。生物體合成是指利用活細胞(如細菌、酵母或哺乳動物細胞)作為“工廠”, 通過調控細胞內的基因表達和代謝途徑,直接在生物體內合成目標基因或分子,這種方法依賴于細胞自身的生物合成機制(如DNA復制、轉錄和翻譯),能夠高效、精準地完成復雜基因序列的合成。


生物體合成的優(yōu)勢:    

√ 高效性:細胞可同時進行多個合成反應,適合大規(guī)模生產(chǎn)。

 精準性:細胞內的天然糾錯機制(如DNA修復系統(tǒng))可減少合成錯誤。

 環(huán)境友好:利用細胞的天然代謝途徑,減少化學廢物的產(chǎn)生。

 多功能性:可同時完成基因合成、表達和功能驗證。


未來挑戰(zhàn):

  代謝干擾:細胞內其他代謝途徑可能干擾目標基因的合成。

  調控難度:需要精確調控基因表達和代謝途徑,避免細胞負擔過重。

  規(guī)?;款i:大規(guī)模細胞培養(yǎng)和基因表達優(yōu)化仍需技術突破。


未來,隨著合成生物學、基因編輯技術等相關領域的不斷進步,生物體合成有望成為未來發(fā)展的主流方向,為基因合成行業(yè)帶來革命性變革。  

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